Süni intellekt gen terapiyası üçün virusları yaxşılaşdırır

Adenoviruslarla (AAV) "əlaqəli" olan dependoviruslar və ya parvoviruslar ABŞ-da çox faydalı vasitədir Gen terapiyası. Bunun səbəbi, DNA-nı hüceyrəyə köçürə bilməsi və insanlar üçün zərərsiz olmasıdır. Bu səbəbdən xəstəliklərlə mübarizə üçün lazım olan genetik məlumatın daşıyıcısı kimi istifadə olunur.

Şəkil mənbəyi: Pixabay

Bununla birlikdə, istifadəsinin hazırda ciddi şəkildə məhdudlaşdırıldığını və bütün xəstələrin bunlardan istifadə edə bilməyəcəyini ifadə edən ciddi məhdudiyyətlər var, buna görə hər kəs gen terapiyası ala bilmir. Bu məhdudiyyətlərdən birincisi məhdud qabiliyyətdir AAV, hüceyrələrə əlavə etmək. İkinci məhdudiyyət insanın immunitet sistemidir. İnsanların 50-70% -nin birinə qarşı olduğu təxmin edilir AAV infeksiyası bu virusun bir növü ilə təmasda olduqları üçün davamlıdırlar. Onların vəziyyətində gen müalicələri nəticə vermir, çünki immunitet sistemi buna vaxt ayırır virus hüceyrəyə girmədən və onunla birlikdə terapiya aparmaq üçün lazım olan genetik materialı məhv etmək. Gen terapiyasının ən vacib tədqiqat sahələrindən biri buna görə cəhddir immun ağıllı olmaq.

Dr. Harvard Universitetinin George Church ilə çalışdı Google Araşdırma və Dyno Therapeutics biri Dərin öyrənmə texnikası AAV virusunun kapsidinin (protein qabığı) çox fərqli variantlarını dizayn etmək üçün istifadə olunur. Tədqiqatçılar, hədəf hüceyrələrin infeksiyasında və virusun tanınması ilə mərkəzi rol oynayan əsas protein seqmentini kodlayan viral genom ardıcıllığına diqqət yetirdilər. immun oynayır.

Mütəxəssislər süni intellektdən istifadə edərək çox sayda fərqləndirmə mümkün olduğunu göstərdilər Capsids sonra immunitet sisteminin hücumundan qaçma qabiliyyətləri üçün test edilə bilər. Tədqiqatçılar birinə az miqdarda məlumat verməyə başladılar Capsid200.000 variantı hədəf almaq.

Araşdırmamız açıq şəkildə tanış olduğumuzu göstərir maşın öyrənmə təbiətdə mövcud olduğundan daha çox, çox sayda variant dizayn edə bilər. Texnologiyamızı təkcə immunitet sisteminin hücumlarına qarşı dura biləcək daşıyıcılar yaratmaqla deyil, həm də seçilmiş toxuma növlərinə daha təsirli və seçici şəkildə yapışdırmaq üçün təkmilləşdirməyə davam edirik "dedi. Dyno Therapeutics-in direktoru və həmtəsisçisi Eric Kelsic.
Nature-da nəşr olunan bir məqalədən AI tərəfindən hazırlanmış kapsidlərin ilkin qiymətləndirməsində demək olar ki, 60% -nin işləyə biləcəyini aşkar etdik. Bu irəliləyiş üçün əhəmiyyətli bir addımdır. Təsadüfi mutagenez hazırda kapsidləri fərqləndirmək üçün istifadə olunur, istifadə edilə bilən kapsidlərin faizi isə 1% -dən azdır.
AAV-nin təbii görünüşündən nə qədər uzaqlaşsaq, immunitet sisteminin onu tanımaması ehtimalı bir o qədər yüksəkdir, komandanı idarə edən Dyno Therapeutics-in digər qurucusu Ph.D. Sam Samina əlavə edir. Kompüter modelləşdirmə yerinə yetirildi. Ancaq müvəffəqiyyətin açarı, DNT yükünü sabit şəkildə daşıya bilən bir kapsid etməkdir. Birinin əldə edilməsinin ənənəvi üsulları Capsids çox vaxt aparan və resurs tələb edən, çox azı isə istifadəyə yararlı olaraq qalır Capsids almaq. Ancaq burada çox böyük bir çeşid tapa bilərik AAV kapsidləri daha da inkişafı üçün əsas olan qazanmaq Gen terapiyaları daha çox insan üçün mövcuddur. "