Digital Taxsaq Tayaq (DTT)

SARS-CoV-2-nin aşkarlanması üçün RT-PCR testinin xaricdən müayinəsi molekulyar və metodoloji səviyyədə 10 əsas elmi çatışmazlığı aşkar edir: Yanlış müsbət nəticələrin nəticələri.

Hörmətli oxucu, bu gün Prof. Albert Einstein-ın bir təklifi ilə başlayacağıq, (Birləşmiş Yəhudi Müraciəti üçün radio yayımından, 11 Aprel 1943):

"Həqiqət və bilik axtarışı insanın bacardığı ən gözəl şeylərdən biridir. Hətta bu peşə ilə fəxr etmək ən az bu cür axtarışlarla doymuşların dodaqlarında olsa da."

Dünya təxminən bir ilə yaxındır Corona pandemiyası işləyən. Vəziyyəti idarə etmək üçün çox sayda tədbir görülmüşdür. Biz DTT Science-Tank Team-də heç vaxt korona pandemiyası mövzusuna müraciət etməmişik. Səbəb olduqca sadədir. Bir mövzuda elmi bir fikir formalaşdırmaq üçün xüsusilə elmdə sağlam və hörmətli bir mübahisəyə ehtiyacınız var. Yaxşı elm adamları bunu həmişə etmişlər. Yalnız kvant fizikasının tarixinə və alimlər arasındakı müxtəlif əfsanəvi davalara baxsanız, elmin necə işlədiyini öyrənəcəksiniz. Təəssüf ki, bu gün yaşandı Corona böhranı İndiyə qədər lazımi bir mübahisədən çətinliklə yoruldum.

Sözsüz ki, hökumətlər tərəfindən həyata keçirilən müxtəlif tədbirlərin əsası PCR testləri təqdim etmək.

2019-cu ilin əvvəlində nəşr olunan əsər: Real vaxt RT-PCR ilə 2019 yeni koronavirus (2019-nCoV) aşkarlanması - burada tapmaq (https://www.eurosurveillance.org/content/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045)

Müəlliflər:

Victor M Corman, Olfert Landt, Marko Kaiser, Richard Molenkamp4, Adam Meijer, Daniel KW Chu6, Tobias Bleicker1, Sebastian Brünink, Julia Schneider, Marie Luisa Schmidt1, Daphne GJC Mulders4, Bart L Haagmans, Bas van der Veer, Sharon van den Brink , Lisa Wijsman, Gabriel Goderski, Jean-Louis Romette, Joanna Ellis, Maria Zambon, Malik Peiris, Herman Goossens, Chantal Reusken, Marion PG Koopmans, Christian Drosten   

məlumdur. Həyata keçirilməsinin əsas tetikleyicisi idi və ola bilər PCR testləri.

Əsərin təfərrüatlarına varmadan birinə nəzər salmaq istərdik Hesabatı nəzərdən keçirin diqqət çəkmək:

Şəkil mənbəyi: Pixabay

SARS-CoV-2-ni aşkar etmək üçün RTPCR testinin xaricdən araşdırılması, molekulyar və metodoloji səviyyədə 10 əsas elmi qüsuru aşkar edir: yanlış müsbət nəticələrin nəticələri - burada tapmaq (https://cormandrostenreview.com/report/)      

Müəllif:

Pieter Borger, Bobby Rajesh Malhotra, Michael Yeadon, Clare Crai, Kevin McKernan, Klaus Steger, Paul McSheehy, Lidiya Angelova, Fabio Franchi, Thomas Binder, Henrik Ullrich, Makoto Ohashi, Stefano Scoglio, Marjolein Doesburg-van Kleffens, Dorothea, Klement, Ruth Schruefer, Berber W. Pieksma, Jan Bonte, Bruno H. Dalle Carbonare, Kevin P. Corbett, Ulrike Kämmerer             

      
Məqalə icmalın vacib məqamlarının Alman dilinə tərcüməsidir: Mənbə (https://cormandrostenreview.com/report/):

SARS-CoV-2-nin aşkarlanması üçün RT-PCR testinin xaricdən müayinəsi molekulyar və metodoloji səviyyədə 10 əsas elmi çatışmazlığı aşkar edir: Yanlış müsbət nəticələrin nəticələri.

"Adlı nəşrdəReal vaxt RT-PCR ilə 2019 yeni koronavirus (2019-nCoV) aşkarlanması"(Eurosurveillance 25 (8) 2020) müəlliflər 2019-nCoV (indi kimi tanınır) aşkarlanması və diaqnozu üçün diaqnostik iş axını və RT-qPCR protokolu təqdim edirlər. SARS-CoV2) təsdiqləndiyini iddia etdikləri və ictimai səhiyyə laboratoriyalarında istifadə üçün möhkəm bir diaqnostika metodologiyası təmin etdiyi. Bu nəşrin dünyadakı cəmiyyətlər üçün nəticələrini nəzərə alaraq bir qrup müstəqil tədqiqatçı yuxarıdakı nəşrdə nöqtə-nəzərdən araşdırma apardı.

1) təqdim olunan test dizaynının bütün komponentləri qarşılıqlı yoxlanılmış,

2) RT-qPCR protokol tövsiyələri yaxşı laboratoriya təcrübəsi üçün qiymətləndirilmişdir

und

3) parametrlər sahədəki müvafiq elmi ədəbiyyatdan istifadə edilərək araşdırılmışdır.

Yayınlandı RT-qPCR protokolu 2019-nCoV və əlyazmanın aşkarlanması və diaqnozu üçün qeyri-kafi bir astar dizaynı, problemli və qeyri-kafi bir çox texniki və elmi səhv var RT-qPCR protokolu və dəqiq olmaması Test doğrulaması. Nə təqdim olunan test, nə də əlyazma özü məqbul elmi bir nəşr üçün tələblərə cavab vermir. Bundan əlavə, müəlliflərin ciddi maraq toqquşmalarından bəhs edilmir. Nəhayət, nəşrin qəbulu ilə qəbulu arasındakı çox qısa bir müddət (24 saat) sistematik olduğunu göstərir Həmkarların nəzərdən keçirilməsi prosesi burada ya həyata keçirilməyib, ya da problemli dərəcədə keyfiyyətsizdir. Bir sıra elmi çatışmazlıqlar barədə inandırıcı dəlillər təqdim edirik, Qüsurlar və qüsurlar.

Burada təqdim olunan elmi və metodiki çatışmazlıqları nəzərə alaraq redaksiya heyətinin əmindir Avrosurğu yayımlamaqdan başqa çarəsi yoxdur geri çəkilmək.



Kağızda tapılan qüsurların xülasə kataloqu


Bu Corman-Drosten kağızı aşağıdakı spesifik səhvləri ehtiva edir:


1. Bu protokoldakı bu son dərəcə yüksək astar konsentrasiyalarından istifadə üçün heç bir səbəb yoxdur. Təsvir edilən konsentrasiyalar, SARS-CoV-2 virusunun aşkarlanması üçün spesifik bir diaqnostik vasitə kimi testi uyğun olmayan hala gətirən qeyri-spesifik bağlanma və PCR məhsulunun gücləndirilməsinə səbəb olur.


2. Altı dəqiqləşdirilməmiş dalğalı mövqe bu testin real laboratoriya tətbiqetmələrində böyük dəyişkənliyə səbəb olur; Corman-Drosten kağızındakı qarışıq, spesifik olmayan təsvir standart bir iş protokolu olaraq uyğun deyil, bu da SARS-CoV-2 virusunu müəyyənləşdirmək üçün müəyyən bir diaqnostik vasitə kimi testi yararsız hala gətirir.


3. Test bütün virus ilə viral fraqmentləri ayırd edə bilmir. Buna görə test bütöv (yoluxucu) viruslar üçün bir diaqnostik vasitə kimi istifadə edilə bilməz, bu da testin SARS-CoV-2 virusunu müəyyənləşdirmək üçün müəyyən bir diaqnostik vasitə kimi uyğun olmadığını və bir virusun olması barədə nəticələrin çıxarılmasına imkan verir. infeksiya.


4. Astar cütü 10 (RdRp_SARSr_F və RdRp_SARSr_R) üçün tavlama temperaturu Tm ilə əlaqəli 1 ° C fərq, SARS-CoV-2 virusunu müəyyənləşdirmək üçün spesifik bir diaqnostik vasitə kimi testi də uyğunsuz edir.


5. Ölümcül səhv nümunənin müsbət və mənfi hesab edildiyi Ct dəyərinin olmamasıdır. Bu Ct dəyəri sonrakı tətbiqetmələrdə də tapılmır və bu da SARS-CoV-2 virusunu aşkarlamaq üçün müəyyən bir diaqnostik vasitə kimi testi uyğunsuz edir.


6. PCR məhsulları molekulyar səviyyədə təsdiqlənməmişdir. Bu fakt protokolu SARS-CoV-2 virusunun aşkarlanması üçün müəyyən bir diaqnostik vasitə kimi istifadə edilə bilməz hala gətirir.


7. PCR testində SARS-CoV-2 üçün spesifikliyini qiymətləndirmək üçün birmənalı müsbət nəzarət və ya digər koronavirusların mövcudluğunu istisna etmək üçün mənfi bir nəzarət yoxdur, bu da testi SARS-CoV-2-nin müəyyənləşdirilməsi üçün müəyyən bir diaqnostik vasitədir. Virus uyğun deyil.


8. Corman-Drosten kağızındakı test dizaynı o qədər qeyri-müəyyən və qüsurludur ki, insan onlarla fərqli istiqamətə gedə bilər; heç bir şey standartlaşdırılmamışdır və SOP yoxdur. Bu, testin elmi etibarlılığını ciddi şəkildə şübhə altına alır və SARS-CoV-2 virusunu müəyyənləşdirmək üçün müəyyən bir diaqnostik vasitə kimi yararsız hala gətirir.


9. Çox güman ki, Corman-Drosten kağızı SARS-CoV-2 virusunu müəyyənləşdirmək üçün spesifik bir diaqnostik vasitə kimi əlverişsiz hala gətirilərək nəzərdən keçirilməmişdir.


10. Corman-Drosten sənədinin müəlliflərindən ikisinin (Christian Drosten və Chantal Reusken) Eurosurveillance redaksiya heyətinin üzvü olmasına əlavə olaraq ən azı dörd müəllifdə ciddi maraq çatışmazlığı tapırıq. 29 iyul 2020-ci il tarixində bir maraq toqquşması əlavə edildi (Olfert Landt TIB-Molbiol-un İdarəedici Direktorudur; Marko Kaiser GenExpress-də baş tədqiqatçıdır və TIB-Molbiol üçün elmi məsləhətçi kimi fəaliyyət göstərir), orijinal versiyasında elan edilmədi (və PubMed -Version hələ itkin); TIB-Molbiol, Corman-Drosten əlyazmasında yayımlanan protokol əsasında PCR dəstləri (Light Mix) istehsal edən "ilk" şirkətdir və öz sözləri ilə bu PCR test dəstlərini nəşrdən əvvəl də satmışdır [20. ]; əlavə olaraq, Victor Corman & Christian Drosten ikinci mənsubiyyətlərindən bəhs etmədilər: "Labor Berlin" ticari test laboratoriyası. Hər ikisi də orada virus diaqnostikasından məsuldur [21] və şirkət real vaxt PCR testləri sahəsində fəaldır.



NƏTİCƏ


Hansı test protokollarının dərc ediləcəyi və ümumiyyətlə əlçatan olacağı barədə qərar Avroservisin əlindədir. Corman-Drosten tədqiqatında aşkar olan səhvlərin tanınması qərarı, üstünlüyə malikdir ki, gələcəkdə insanların xərcləri və əziyyətləri çox azaldılacaq.
Bu sənədin geri götürülməsi Eurosurveillance-in ən yaxşı maraqlarına uyğun deyilmi? Nəticəmiz bəllidir. Burada təsvir olunan bütün böyük PCR protokol dizayn qüsurlarını və qüsurlarını nəzərə alaraq, elmi bütövlük və məsuliyyət çərçivəsində çox seçim qalmadığına inanırıq.



KREDİTALAR


[1] Corman Victor M, Landt Olfert, Kaiser Marco, Molenkamp Richard, Meijer Adam, Chu Daniel KW, Bleicker Tobias, Brünink Sebastian, Schneider Julia, Schmidt Marie Luisa, Mulders Daphne GJC, Haagmans Bart L, van der Veer Bas, van den Brink Sharon, Wijsman Lisa, Goderski Gabriel, Romette Jean-Louis, Ellis Joanna, Zambon Maria, Peiris Malik, Goossens Herman, Reusken Chantal, Koopmans Marion PG, Drosten Christian. Real vaxt RT-PCR ilə 2019 yeni koronavirus (2019-nCoV) aşkarlanması. Euro Surveill. 2020; 25 (3): pii = 2000045. https://doi.org/10.2807/1560-7917.ES.2020.25.3.2000045


[2] Dr. arasında elektron poçt rabitəsi Peter Borger və Dr. Adam Meijer: Əlavə material


[3] Jafaar et al., 3790 Kəmiyyət Polimeraz Zəncir Reaksiyası - Müsbət Nümunələr və Pozitiv Hüceyrə Kültürləri arasında Korrelyasiya, 1941 Ciddi Kəskin Tənəffüs Sindromu Koronavirus 2 İzolatı da daxil olmaqla. https://academic.oup.com/cid/advance-article/doi/10.1093/cid/ciaa1491/5912603


[4] BBC, 21 yanvar 2020: https://www.bbc.com/news/world-asia-china-51185836;
Arxiv: https://archive.is/0qRmZ


[5] Google Analytics - COVID19-dünya ölümü: https://bit.ly/3fndemJ
Arxiv: https://archive.is/PpqEE


[6] NIVD altında olan COVID-19 Təcili Müdaxilə Texniki Mərkəzi üçün laboratoriya testi
Çin CDC 15 Mart 2020: http://www.chinacdc.cn/en/COVID19/202003/P020200323390321297894.pdf


[7] Real-Time PCR El Kitabı Həyat Texnologiyaları: https://www.thermofisher.com/content/dam/LifeTech/global/Forms/PDF/real-time-pcr-
handbook.pdf Nolan T, Huggett J, Sanchez E. Kəmiyyət PCR (qPCR) tətbiqi üçün yaxşı təcrübə bələdçisi First Edition 2013


[8] Trestan Pillonel və digərləri, Redaktora məktub: SARS-CoV-2 real vaxt RT-PCR ilə aşkarlanması: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7268274/


[9] Kurkela, Satu və David WG Brown. "Molekulyar-diaqnostika üsulları." Tibb 38.10
(2009): 535-540.


[10] Wolfel et al., COVID-2019 xəstəxanaya yerləşdirilmiş xəstələrin viroloji qiymətləndirilməsi
https://www.nature.com/articles/s41586-020-2196-x


[11] Thermofischer Primer Dimer Veb Aləti: https://www.thermofisher.com/us/en/home/brands/thermo-scientific/molecular-biology/molecular-biology-learning-center/molecular-biology-resource-library /thermo-scientific-web-tools/multiple-primer-analyzer.html

[12] Primer-BLAST, NCBI - Milli Biotexnologiya Məlumat Mərkəzi: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/


[13] Marra MA, Steven JMJ, Caroline RA, Robert AH, Angela BW et al. (2003) Elm. SARS ilə əlaqəli koronavirusun Genom sırası. Elm 300 (5624): 1399-1404.


[14] Ağır kəskin tənəffüs sindromu koronavirus 2, tam genom olan Wuhan-Hu-1-i təcrid edir: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MN908947


[15] Borger P. SARS-ə bənzər bir Coronavirus gözlənilən idi, lakin hazırlanacaq bir şey edilmədi. J Biomed Sci Res 2020-də. Https://biomedgrid.com/pdf/AJBSR.MS.ID.001312.pdf
https://www.researchgate.net/publication/341120750_A_SARS-like_Coronavirus_was_Expected_but_nothing_was_done_to_be_Prepared;  Arxiv: https://archive.is/i76Hu


[16] Eurosurveillance kağız qiymətləndirmə / nəzərdən keçirmə prosesi: https://www.eurosurveillance.org/evaluation

[17] ÜST tərəfindən Corman-Drosten protokolunun və əlyazmasının rəsmi tövsiyəsi, sənədin 13 versiyası olaraq 2020 yanvar 1.0-ci il tarixində yayımlandı: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/wuhan-virus -sayə-
v1991527e5122341d99287a1b17c111902.pdf; archive: https://bit.ly/3m3jXVH

[18] Doğrudan da Eurosurveillance-nəşrindən, sənəd-versiya 2-1-dən əldə olunan Corman / Drosten RT-qPCR-protokolu üçün ÜST-nin rəsmi tövsiyəsi
17th January 2020: https://www.who.int/docs/default-source/coronaviruse/protocol-v2-1.pdf?sfvrsn=a9ef618c_2

[19] Eurosurveillance Redaksiya heyəti, 2020: https://www.eurosurveillance.org/upload/site-assets/imgs/2020-09-Editorial%20Board%20PDF.pdf; Arxiv: https://bit.ly/2TqXBjX

[20] LightMix SarbecoV E-gen plus EAV Control, TIB-Molbiol & Roche Molecular Solutions, 11 Yanvar 2020 üçün istifadə təlimatları: https://www.roche-as.es/lm_pdf/MDx_40-0776_96_Sarbeco-E-gene_V200204 (09164154001) ) .pdf
Arxiv, zaman damgası - 11 Yanvar 2020: https://archive.is/Vulo5;  Arxiv: https://bit.ly/3fm9bXH [21] Xristian Drosten və Victor Corman, Labor Berlin-də virus diaqnozundan məsul:
https://www.laborberlin.com/fachbereiche/virologie/  Arxiv: https://archive.is/CDEUG

[22] Tom Jefferson, Elizabeth Spencer, Jon Brassey, Carl Heneghan COVID-19 infeksiya qiymətləndirməsi üçün Virus mədəniyyətləri. Sistematik icmal. Sistematik icmal doi: https://doi.org/10.1101/2020.08.04.20167932-XNUMX-XNUMX-XNUMX https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.08.04.20167932v4

[23] Kim və digərləri, SARS-CoV-2 Memarlığı Transkriptom: https://www.sc тизирута.com/science/article/pii/S0092867420304062

[24] ECDC'nin Dr. Peter Borger, 18 Noyabr 2020: Əlavə Material

[25] Prof. Dr. Ulrike Kämmerer və komanda, anket və Primer-BLAST cədvəli